Trnavská univerzita v Trnave patrí k najvýznamnejším vzdelávacím inštitúciám v regióne trnavského kraja. V oblasti vzdelávania a výchovy dlhodobo spolupracuje s inými akademickými inštitúciami. Významným partnerom univerzity od obnovenia jej činnosti je Mesto Trnava. V poslednom období sa úspešne začala rozvíjať aj spolupráca s Trnavským samosprávnym krajom. Zmluvnými partnermi Trnavskej univerzity v rôznych oblastiach regionálnej spolupráce sú:
- Mesto Trnava
- Materiálovotechnologická fakulta STU v Trnave
- Vysoká škola v Sládkovičove
- Volksbank Slovensko, a.s., Bratislava
- Slovenská poisťovňa, a.s. Bratislava